Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcr2P35343 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cxcr2P35343 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcr2P35343 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms