Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pou3f3P31361 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pou3f3P31361 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pou3f3P31361 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pou3f3P31361 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pou3f3P31361 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pou3f3P31361 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pou3f3P31361 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pou3f3P31361 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pou3f3P31361 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms