Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tacr1P30548 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms