Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VtnP29788 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VtnP29788 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VtnP29788 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VtnP29788 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VtnP29788 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VtnP29788 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VtnP29788 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VtnP29788 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VtnP29788 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VtnP29788 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VtnP29788 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VtnP29788 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VtnP29788 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VtnP29788 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VtnP29788 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VtnP29788 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VtnP29788 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VtnP29788 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VtnP29788 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VtnP29788 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VtnP29788 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VtnP29788 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VtnP29788 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VtnP29788 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VtnP29788 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VtnP29788 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VtnP29788 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VtnP29788 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VtnP29788 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VtnP29788 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VtnP29788 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VtnP29788 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VtnP29788 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VtnP29788 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VtnP29788 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VtnP29788 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VtnP29788 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VtnP29788 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VtnP29788 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VtnP29788 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VtnP29788 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VtnP29788 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VtnP29788 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VtnP29788 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VtnP29788 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VtnP29788 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VtnP29788 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VtnP29788 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VtnP29788 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VtnP29788 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VtnP29788 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VtnP29788 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VtnP29788 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VtnP29788 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VtnP29788 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VtnP29788 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VtnP29788 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VtnP29788 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VtnP29788 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VtnP29788 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VtnP29788 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VtnP29788 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VtnP29788 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VtnP29788 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VtnP29788 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VtnP29788 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VtnP29788 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VtnP29788 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VtnP29788 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VtnP29788 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VtnP29788 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VtnP29788 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VtnP29788 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VtnP29788 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VtnP29788 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VtnP29788 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VtnP29788 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VtnP29788 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VtnP29788 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VtnP29788 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VtnP29788 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VtnP29788 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VtnP29788 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VtnP29788 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VtnP29788 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VtnP29788 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VtnP29788 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VtnP29788 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VtnP29788 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VtnP29788 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VtnP29788 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VtnP29788 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VtnP29788 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VtnP29788 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VtnP29788 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VtnP29788 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VtnP29788 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VtnP29788 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VtnP29788 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.9 ms