Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd10P28359 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd10P28359 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxd10P28359 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms