Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb9P28076 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb9P28076 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms