Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Cdk11bP24788 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cdk11bP24788 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cdk11bP24788 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms