Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd12P23812 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd12P23812 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms