Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm3P21107 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3P21107 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tpm3P21107 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3P21107 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms