Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifrd1P19182 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifrd1P19182 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms