Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phka1P18826 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phka1P18826 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phka1P18826 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Phka1P18826 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phka1P18826 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phka1P18826 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Phka1P18826 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phka1P18826 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phka1P18826 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Phka1P18826 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phka1P18826 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phka1P18826 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phka1P18826 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phka1P18826 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phka1P18826 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phka1P18826 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phka1P18826 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phka1P18826 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phka1P18826 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phka1P18826 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phka1P18826 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phka1P18826 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phka1P18826 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phka1P18826 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phka1P18826 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms