Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsdP18242 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsdP18242 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsdP18242 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsdP18242 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsdP18242 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsdP18242 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsdP18242 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsdP18242 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsdP18242 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsdP18242 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsdP18242 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsdP18242 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsdP18242 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsdP18242 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsdP18242 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsdP18242 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsdP18242 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsdP18242 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsdP18242 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsdP18242 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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