Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata1P17679 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata1P17679 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata1P17679 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata1P17679 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata1P17679 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata1P17679 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata1P17679 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata1P17679 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata1P17679 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata1P17679 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata1P17679 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata1P17679 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms