Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spi1P17433 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spi1P17433 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spi1P17433 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spi1P17433 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spi1P17433 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spi1P17433 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spi1P17433 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spi1P17433 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spi1P17433 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms