Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RhoP15409 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RhoP15409 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RhoP15409 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RhoP15409 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhoP15409 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhoP15409 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhoP15409 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhoP15409 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhoP15409 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhoP15409 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RhoP15409 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RhoP15409 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RhoP15409 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RhoP15409 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RhoP15409 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RhoP15409 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RhoP15409 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RhoP15409 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RhoP15409 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RhoP15409 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RhoP15409 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RhoP15409 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RhoP15409 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RhoP15409 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RhoP15409 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoP15409 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoP15409 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoP15409 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoP15409 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoP15409 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhoP15409 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RhoP15409 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RhoP15409 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RhoP15409 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RhoP15409 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RhoP15409 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RhoP15409 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RhoP15409 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RhoP15409 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RhoP15409 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RhoP15409 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhoP15409 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhoP15409 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhoP15409 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhoP15409 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhoP15409 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhoP15409 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhoP15409 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhoP15409 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhoP15409 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhoP15409 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhoP15409 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhoP15409 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhoP15409 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhoP15409 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhoP15409 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhoP15409 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhoP15409 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhoP15409 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoP15409 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoP15409 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoP15409 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoP15409 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoP15409 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoP15409 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoP15409 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoP15409 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoP15409 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoP15409 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoP15409 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhoP15409 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RhoP15409 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RhoP15409 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RhoP15409 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RhoP15409 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RhoP15409 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RhoP15409 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RhoP15409 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RhoP15409 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RhoP15409 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RhoP15409 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RhoP15409 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoP15409 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoP15409 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoP15409 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoP15409 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoP15409 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoP15409 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoP15409 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoP15409 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoP15409 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoP15409 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhoP15409 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhoP15409 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhoP15409 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhoP15409 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhoP15409 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhoP15409 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhoP15409 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms