Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcp1P11983 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcp1P11983 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcp1P11983 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcp1P11983 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcp1P11983 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcp1P11983 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcp1P11983 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms