Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Schip1P0DPB4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Schip1P0DPB4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms