Protein–RNA interactions for Protein: P0CB42

Alkbh1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh1P0CB42 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh1P0CB42 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alkbh1P0CB42 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh1P0CB42 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms