Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb2P0C1T1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb2P0C1T1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb2P0C1T1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb2P0C1T1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb2P0C1T1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb2P0C1T1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb2P0C1T1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb2P0C1T1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb2P0C1T1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxb2P0C1T1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms