Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01797 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01797 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01797 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01797 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01797 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01797 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01797 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01797 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01797 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01797 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01797 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01797 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01797 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01797 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01797 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01797 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01797 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01797 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01797 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01797 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01797 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01797 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01797 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01797 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01797 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01797 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01797 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01797 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01797 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01797 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01797 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01797 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01797 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01797 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01797 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01797 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01797 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01797 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01797 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01797 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01797 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01797 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01797 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01797 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01797 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01797 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01797 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01797 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01797 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01797 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01797 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01797 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01797 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01797 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01797 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01797 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01797 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01797 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
P01797 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01797 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01797 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01797 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01797 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01797 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
P01797 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01797 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01797 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01797 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01797 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01797 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01797 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01797 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01797 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01797 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01797 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01797 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01797 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01797 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01797 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01797 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01797 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01797 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01797 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01797 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01797 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01797 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P01797 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01797 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01797 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01797 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P01797 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01797 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01797 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01797 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01797 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01797 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01797 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01797 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01797 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms