Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01738 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01738 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01738 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01738 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01738 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01738 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01738 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01738 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01738 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01738 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01738 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01738 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01738 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01738 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01738 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01738 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01738 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01738 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01738 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01738 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01738 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01738 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01738 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01738 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01738 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01738 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01738 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01738 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01738 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01738 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01738 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01738 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01738 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01738 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01738 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01738 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01738 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01738 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01738 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01738 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01738 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01738 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01738 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01738 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01738 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01738 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01738 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01738 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01738 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01738 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01738 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01738 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01738 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01738 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01738 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01738 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01738 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01738 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01738 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01738 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01738 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01738 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01738 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01738 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01738 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01738 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01738 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01738 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01738 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01738 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01738 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01738 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01738 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01738 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01738 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01738 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01738 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01738 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01738 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01738 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01738 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01738 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01738 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01738 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01738 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01738 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01738 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01738 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01738 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01738 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01738 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01738 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01738 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01738 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01738 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01738 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01738 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01738 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01738 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms