Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01673 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01673 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
P01673 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
P01673 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01673 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01673 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01673 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01673 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01673 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01673 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01673 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01673 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01673 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01673 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01673 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01673 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01673 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
P01673 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01673 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01673 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01673 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01673 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01673 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01673 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01673 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01673 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01673 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01673 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
P01673 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01673 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01673 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01673 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01673 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01673 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
P01673 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01673 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
P01673 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01673 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01673 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01673 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01673 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01673 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01673 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01673 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01673 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01673 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01673 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01673 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01673 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01673 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01673 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01673 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01673 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01673 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01673 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01673 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01673 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01673 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01673 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01673 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01673 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01673 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01673 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01673 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01673 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01673 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01673 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01673 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01673 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01673 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01673 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01673 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
P01673 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01673 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01673 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01673 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01673 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01673 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01673 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01673 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01673 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01673 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01673 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01673 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01673 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01673 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01673 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01673 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
P01673 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01673 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms