Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01653 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01653 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01653 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01653 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01653 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01653 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01653 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01653 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01653 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01653 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01653 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01653 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01653 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01653 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01653 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
P01653 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01653 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01653 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01653 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01653 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01653 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01653 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01653 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01653 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
P01653 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01653 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01653 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01653 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01653 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01653 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01653 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01653 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01653 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01653 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
P01653 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01653 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01653 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
P01653 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01653 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01653 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01653 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01653 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01653 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01653 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01653 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P01653 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01653 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01653 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01653 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
P01653 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01653 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01653 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01653 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01653 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01653 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01653 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01653 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01653 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01653 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01653 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01653 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01653 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01653 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01653 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01653 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
P01653 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01653 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01653 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01653 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01653 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01653 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01653 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01653 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01653 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01653 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01653 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01653 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01653 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01653 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01653 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01653 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01653 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01653 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01653 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01653 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01653 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01653 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01653 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01653 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01653 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01653 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01653 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01653 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01653 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01653 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01653 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01653 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01653 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01653 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127 ms