Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Orc4O88708 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Orc4O88708 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Orc4O88708 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Orc4O88708 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Orc4O88708 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Orc4O88708 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Orc4O88708 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Orc4O88708 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Orc4O88708 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Orc4O88708 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Orc4O88708 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Orc4O88708 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Orc4O88708 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Orc4O88708 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186 ms