Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema3fO88632 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema3fO88632 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema3fO88632 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms