Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Dnmt3aO88508 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnmt3aO88508 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms