Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc4a4O88343 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc4a4O88343 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc4a4O88343 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc4a4O88343 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc4a4O88343 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc4a4O88343 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc4a4O88343 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc4a4O88343 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc4a4O88343 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc4a4O88343 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slc4a4O88343 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms