Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cfdp1O88271 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cfdp1O88271 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cfdp1O88271 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms