Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg2O55111 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg2O55111 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg2O55111 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms