Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syngr2O55101 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.3 ms