Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngr1O55100 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syngr1O55100 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syngr1O55100 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms