Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Bnip3O55003 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Bnip3O55003 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bnip3O55003 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bnip3O55003 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bnip3O55003 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms