Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cldn5O54942 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn5O54942 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms