Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TsksO54887 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TsksO54887 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TsksO54887 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TsksO54887 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TsksO54887 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TsksO54887 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TsksO54887 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TsksO54887 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TsksO54887 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TsksO54887 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TsksO54887 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TsksO54887 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TsksO54887 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TsksO54887 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TsksO54887 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TsksO54887 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TsksO54887 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TsksO54887 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TsksO54887 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TsksO54887 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TsksO54887 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TsksO54887 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TsksO54887 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TsksO54887 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TsksO54887 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TsksO54887 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TsksO54887 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TsksO54887 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TsksO54887 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TsksO54887 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TsksO54887 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TsksO54887 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TsksO54887 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TsksO54887 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TsksO54887 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TsksO54887 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TsksO54887 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TsksO54887 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TsksO54887 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TsksO54887 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TsksO54887 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TsksO54887 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TsksO54887 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TsksO54887 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TsksO54887 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TsksO54887 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TsksO54887 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TsksO54887 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TsksO54887 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TsksO54887 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TsksO54887 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TsksO54887 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TsksO54887 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TsksO54887 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TsksO54887 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TsksO54887 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TsksO54887 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TsksO54887 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TsksO54887 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TsksO54887 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TsksO54887 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TsksO54887 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TsksO54887 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TsksO54887 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TsksO54887 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TsksO54887 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TsksO54887 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TsksO54887 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TsksO54887 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TsksO54887 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TsksO54887 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TsksO54887 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TsksO54887 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TsksO54887 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TsksO54887 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TsksO54887 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TsksO54887 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TsksO54887 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TsksO54887 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TsksO54887 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TsksO54887 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TsksO54887 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TsksO54887 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TsksO54887 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TsksO54887 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TsksO54887 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TsksO54887 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TsksO54887 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TsksO54887 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TsksO54887 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TsksO54887 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TsksO54887 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TsksO54887 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TsksO54887 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TsksO54887 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TsksO54887 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TsksO54887 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TsksO54887 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TsksO54887 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms