Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csnk2a2O54833 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk2a2O54833 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms