Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Srpk2O54781 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Srpk2O54781 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Srpk2O54781 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Srpk2O54781 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Srpk2O54781 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Srpk2O54781 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Srpk2O54781 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms