Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sdc4O35988 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdc4O35988 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdc4O35988 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms