Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dsg3O35902 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dsg3O35902 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms