Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema4dO09126 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4dO09126 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sema4dO09126 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema4dO09126 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms