Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E5

Vmn2r39, Vomeronasal 2, receptor 39, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r39L7N2E5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r39L7N2E5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r39L7N2E5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r39L7N2E5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r39L7N2E5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r39L7N2E5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r39L7N2E5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r39L7N2E5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r39L7N2E5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r39L7N2E5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r39L7N2E5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r39L7N2E5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r39L7N2E5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r39L7N2E5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r39L7N2E5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vmn2r39L7N2E5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms