Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E2

Gm8271, Predicted gene 8271, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8271L7N2E2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm8271L7N2E2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm8271L7N2E2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm8271L7N2E2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm8271L7N2E2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm8271L7N2E2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm8271L7N2E2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm8271L7N2E2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm8271L7N2E2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm8271L7N2E2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm8271L7N2E2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm8271L7N2E2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm8271L7N2E2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gm8271L7N2E2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm8271L7N2E2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm8271L7N2E2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gm8271L7N2E2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm8271L7N2E2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm8271L7N2E2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm8271L7N2E2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm8271L7N2E2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm8271L7N2E2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms