Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm8356J3QPD3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm8356J3QPD3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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