Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim18J3QNP2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim18J3QNP2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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