Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28051J3QMA2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28051J3QMA2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms