Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zc3h7bF8VPP8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h7bF8VPP8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h7bF8VPP8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms