Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh9F8VPK8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh9F8VPK8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pcdh9F8VPK8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms