Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8220F6YKI2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms