Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igkv1-99F6XWB2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms