Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm8444F6XS56 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8444F6XS56 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms