Protein–RNA interactions for Protein: F6XJP7

Pcsk6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk6F6XJP7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk6F6XJP7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcsk6F6XJP7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcsk6F6XJP7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcsk6F6XJP7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcsk6F6XJP7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk6F6XJP7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk6F6XJP7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk6F6XJP7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcsk6F6XJP7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcsk6F6XJP7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcsk6F6XJP7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms